O que a criptografia não protege

Criptografia não impede um atacante de apagar todos os seus dados.
Um atacante pode comprometer seu programa de criptografia. O atacante pode modificar o programa para usar uma chave diferente da que você gerou ou talvez gravar todas chaves de encriptção em um arquivo para análise posterior.
Um atacante pode encontrar uma forma relativamente fácil de decriptografar as mensagem conforme o algorítimo que você esteja usando.
Um atacante pode acessar seus arquivos antes de você encripta-lo ou após a decripatação.

Por tudo isso, a criptografia deve fazer parte da sua estratégia de segurança, mas não deve ser a substituta de outras técnicas de segurança.

Referências :